Ahiru est le protagoniste de l'histoire et est élève dans une école artistique à la section ballet. Cependant, elle se révèle être une pitoyable danseuse, loin de la grâce de ses camarades de classe mais comme le dit Paulamoni, la grande ballerine "la façon de danser de cette jeune fille n'est pas élégante du tout mais elle est débordante de bonne volonté". Elle est aussi Princess Tutu.

Fakir est le camarade de chambre de Mute, ainsi que l'une des deux seuls personne avec qui il est proche. Il est très protecteur avec Mute, mais agit souvent de manière indifférente, voir désagréable. Au début, Ahiru le considère comme un "pauvre type". C'est un excellent danseur.

Mute est le "beau gosse" et l'un des meilleurs danseurs de l'école, ce qui lui vaut beaucoup d'admiration de la part des filles. Il n'est cependant proche que de Rue et Fakia. C'est un jeune homme froid et sans émotion apparente dont le regard semble toujours triste aux yeux de Ahiru. Elle comprendra rapidement que Mute est le prince dont lui parle Drosselmeyer, et qu'il a quitté l'histoire à laquelle il appartenait. Il a perdu son coeur, brisé et dispersé un peu partout. Princesse Tutu va peu à peu l'aider à retrouver tous les morceaux.

Rue est la jeune fille la plus douée en danse de toute l'école. Elle fait partie de la classe spéciale de danse, celle sur qui toutes les élèves des classes d'apprentissage doivent prendre exemple. Elle est également la petite amie de Mute si l'on peut parler d'amour car il est à sens unique, étant donné que Mute ignore ce qu'est l'amour et se laisse faire. Elle est aussi Princesse Kraehe

Pike est l'une des deux amies de Ahiru. Elle est assez douée en danse et tente de motiver Ahiru lorsque celle-ci est en difficulté. C'est une jeune fille assez impulsive.

Ririe est l'amie de Pike et Ahiru. Elle est d'un naturel calme et posé, contrairement à Pike. Elle est parfois un peu dans les nuages, et il lui arrive de dire des vérités qui font mal sans s'en rendre compte.

Drosselmeyer est l'auteur de l'histoire inachevé. On sait peu de choses à son sujet, si ce n'est qu'il est mort il y a quelques années. Il continue toutefois d'influer sur le cours des évènements, en donnant le pendentif à Ahiru notamment. Il est également celui qui décide plus ou moins du déroulement de l'histoire.

Neko-sensei est le professeur de danse de l'école. Il est très sérieux et très compétent, mais il a cependant une manie relativement gênante pour ses élèves. En effet, il menace souvent ceux-ci de mariage avec lui s'ils échouent à un exercice ou un examen.

Edel est une mystérieuse jeune fille. Elle apparait toujours mystérieusement, et disparaît aussi étrangement qu'elle est venue. Son arrivé et sa présence sont annoncés par le son de son orgue de barbarie. Elle connait le secret de Ahiru et semble vouloir l'aider.

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